Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms