Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms