Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS4P35443 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS4P35443 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS4P35443 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS4P35443 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS4P35443 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS4P35443 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS4P35443 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS4P35443 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS4P35443 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms