Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC1P35251 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC1P35251 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFC1P35251 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFC1P35251 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFC1P35251 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC1P35251 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC1P35251 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC1P35251 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC1P35251 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC1P35251 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC1P35251 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms