Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI1P31150 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI1P31150 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI1P31150 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI1P31150 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI1P31150 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDI1P31150 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDI1P31150 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDI1P31150 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI1P31150 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI1P31150 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI1P31150 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI1P31150 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI1P31150 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI1P31150 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI1P31150 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDI1P31150 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI1P31150 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI1P31150 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI1P31150 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI1P31150 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI1P31150 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms