Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINB3P29508 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms