Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF8P28908 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms