Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD27P26842 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CD27P26842 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD27P26842 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD27P26842 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD27P26842 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD27P26842 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD27P26842 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD27P26842 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD27P26842 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms