Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
HMGB2P26583 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms