Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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