Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK11BP21127 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms