Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms