Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB1P20618 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB1P20618 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms