Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC3P19447 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms