Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL17P18621 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL17P18621 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL17P18621 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL17P18621 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL17P18621 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL17P18621 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL17P18621 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL17P18621 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL17P18621 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL17P18621 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL17P18621 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL17P18621 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL17P18621 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms