Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA1P17302 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA1P17302 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA1P17302 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA1P17302 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA1P17302 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA1P17302 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA1P17302 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA1P17302 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA1P17302 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA1P17302 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms