Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA2P17301 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms