Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CPEP16870 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CPEP16870 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CPEP16870 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CPEP16870 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CPEP16870 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CPEP16870 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CPEP16870 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CPEP16870 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CPEP16870 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CPEP16870 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CPEP16870 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CPEP16870 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CPEP16870 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms