Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms