Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UCHL3P15374 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms