Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH1P12830 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH1P12830 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH1P12830 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH1P12830 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH1P12830 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH1P12830 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH1P12830 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH1P12830 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH1P12830 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms