Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms