Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms