Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT7P08729 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT7P08729 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT7P08729 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT7P08729 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT7P08729 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT7P08729 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT7P08729 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms