Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE6O95741 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CPNE6O95741 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CPNE6O95741 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CPNE6O95741 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPNE6O95741 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE6O95741 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE6O95741 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE6O95741 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE6O95741 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE6O95741 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPNE6O95741 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms