Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPBO95292 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPBO95292 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPBO95292 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPBO95292 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAPBO95292 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAPBO95292 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAPBO95292 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPBO95292 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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