Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG13O75143 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG13O75143 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG13O75143 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms