Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms