Protein–RNA interactions for Protein: O60543

CIDEA, Cell death activator CIDE-A, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEAO60543 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIDEAO60543 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms