Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX6O43752 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX6O43752 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX6O43752 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX6O43752 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX6O43752 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX6O43752 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX6O43752 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX6O43752 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX6O43752 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX6O43752 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX6O43752 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX6O43752 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX6O43752 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX6O43752 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX6O43752 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX6O43752 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX6O43752 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX6O43752 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX6O43752 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX6O43752 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX6O43752 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX6O43752 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX6O43752 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX6O43752 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX6O43752 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX6O43752 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX6O43752 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX6O43752 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms