Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DENRO43583 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENRO43583 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DENRO43583 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENRO43583 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENRO43583 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENRO43583 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DENRO43583 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DENRO43583 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms