Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF3O43395 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms