Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD3O43242 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms