Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM66O15016 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM66O15016 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms