Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1O14717 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1O14717 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms