Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC9O14530 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms