Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01387J3KSC0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms