Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VWA3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VWA3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VWA3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VWA3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8VWA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms