Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
E9PCH4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
E9PCH4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
E9PCH4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
E9PCH4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
E9PCH4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
E9PCH4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
E9PCH4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
E9PCH4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
E9PCH4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
E9PCH4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
E9PCH4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
E9PCH4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
E9PCH4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
E9PCH4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
E9PCH4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
E9PCH4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
E9PCH4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
E9PCH4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
E9PCH4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
E9PCH4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
E9PCH4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
E9PCH4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
E9PCH4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
E9PCH4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
E9PCH4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
E9PCH4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
E9PCH4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
E9PCH4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
E9PCH4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
E9PCH4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
E9PCH4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
E9PCH4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
E9PCH4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
E9PCH4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
E9PCH4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
E9PCH4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
E9PCH4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
E9PCH4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
E9PCH4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
E9PCH4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
E9PCH4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
E9PCH4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
E9PCH4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
E9PCH4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
E9PCH4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
E9PCH4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms