Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms