Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOL1A6NHN0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOL1A6NHN0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOL1A6NHN0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms