Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms