Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP5LA4QPB2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP5LA4QPB2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms