Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HTR3D-203ENST00000428798 1215 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HTR3D-204ENST00000453435 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CEP57L1-204ENST00000407272 1947 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SPOP-205ENST00000503676 1932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AL591643.1-201ENST00000561587 1900 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ZNF548-201ENST00000336128 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CLK4-208ENST00000520957 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LAMP5-201ENST00000246070 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC008663.2-201ENST00000517299 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LINC01429-201ENST00000438154 2326 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MRPL24-201ENST00000361531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 KANK1P1-201ENST00000400619 1234 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 BX571846.1-201ENST00000447347 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 AC012377.1-201ENST00000499797 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 OR2A9P-202ENST00000479102 1990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 NIF3L1-201ENST00000359683 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ATXN8OS-201ENST00000414504 1148 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PRSS3-204ENST00000429677 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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