Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms