Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms