Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms