Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO2Q9Y3B8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms