Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2J1Q9Y385 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2J1Q9Y385 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms