Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX2Q9Y2T7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YBX2Q9Y2T7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms